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在App Store购买应用或服务时，扣费一般会通过以下途径进行。
1、绑定的银行卡：如果微信或支付宝绑定了银行卡，并在App Store中使用了这些支付方式，那么购买产生的费用将会自动从绑定的银行卡中扣除。
2、支付宝余额或花呗：如果在App Store购买时选择了支付宝作为支付方式，那么会直接从支付宝的余额或者花呗中进行扣费。
3、Apple ID余额：在App Store购买应用或服务时，也可以使用Apple ID余额支付部分或全部费用，这种余额可以通过iTunes Store或App Store购买商品后剩余产生，如果选择使用Apple ID余额支付，扣费将直接从该余额中扣除。
具体的扣费方式可能会因账户设置、地区等因素有所不同，如有疑问，可以登录相应的账户查看交易记录，或者联系苹果客服进行咨询，请确保支付方式的安全性和有效性，避免不必要的损失。